海关事务担保的三种情形，其中申请提前放行货物担保最为普遍。海关提供通关担保主要是为了企业提供通关便利，同时也是针对海关行政程序中对其他企业申报的报关单证审核风险处置的需要。担保人提供的担保应当与被担保人依法履行的海关义务相适应。申请报关单证担保主要涉及担保人提交的报关单证在种类、格式、内容等方面不符合海关审单要求问题，以及有关进出口许可证件电子联网后企业已领取纸面许可证件后电子数据尚未传输到报关地海关等情况。但是，申请报关单证担保不包括国家限制进出口货物、未领到进出口许可证件以及有国家特殊管理规定的进出口货物未能向海关交验有关主管部门批准文件或证明的情形。
申请提前放行货物的报关单证担保应当书面向海关提出申请。报关单证担保申请书主要包含三个部分：第一部分为担保人资信，内容包括报关员名称、报关证号、担保企业名称、企业法人代表、企业地址、联系电话、企业开户银行、开户账号和企业公章等；第二部分为进出口货物主要信息，内容包括报关单号、进出口日期、运输方式、贸易国别、报关单证、商品名称、商品编码、规格型号、数量、计量单位、金额和币制等；第三部分为申请担保事项，内容包括申请担保时间、申请担保种类、申请担保理由、担保范围和期限、担保责任以及海关认为需要说明的事项和备注等。
申请报关单证担保的操作流程是：报关员根据报关单证的担保申请内容，按照海关要求的保证函格式内容进行书面申请。有些可以通过海关提供的“保函管理系统”输入电子文本，有些则可由企业自行制发纸面文本。经核对无误后，打印三份文件（一份随报关单流转，一份留存海关担保岗位登记管理，一份报关员凭以办理核销），并加盖担保单位公章。报关员携有关报关单证到海关通关现场提交担保申请书和纸面报关单、代理报关委托书、合同、发票、提单（运单）、装箱单、加工贸易备案手册和涉及贸易管制证件复印件等。必要时，还应按海关要求出示相关的证件资料。
海关受理担保申请书后，会根据报关单证上显示的进出口货物，核对担保内容、担保人资格、担保期限、担保人签字、担保单位公章等内容。经过审批同意后，报关单证的担保申请即生效。企业可以按照正常情况办理通关放行手续。其中，进出口通关单（进口废物除外）、出口核销单和商业单证等文件可简化为由经办关员一级审批。而其余类型的保函则需要经过二级或三级审批。
一般情况下，海关会在1个工作日内完成报关单证担保申请审批手续。如果有特殊情况，则需要在3个工作日内答复是否接受担保申请。如果海关不同意提供担保，则应在担保申请书上批注不接受担保的理由，并告知申请人可依法维护申报权利。
如果因特殊情况需要更改担保内容，则报关员应当在履行完毕担保义务之前向接受担保的海关通关现场提出书面申请，格式和内容与原始的担保申请书相同，并提交相关的证明文件资料。一般情况下，海关会严格控制担保内容的更改。变更担保需要经过三级审批，并在3个工作日内答复是否接受担保更改申请。
在履行完毕担保义务之后，报关员应当及时向海关提交书面的担保核销申请。经海关审核担保人提交的单证与担保内容一致性，对符合核销要求的，有些海关可以在“保函管理系统”中进行相应的核销操作。而有些海关则会在企业自行制发的纸面保函文本中批注核销意见。报关员应当按照报关单证管理要求妥善保管担保申请书，以备接受海关后续管理需要。
出口报关单证的担保期限一般为7天，进口报关单证的担保期限一般为20天。如果需要延期，则担保人应该在到期前向海关提出延期申请。海关将根据具体进出口货物、担保人通关信用等因素来评估相关风险情况，并按照有关规定予以延期。对于到期未能核销担保的企业和报关员，海关将按照行政处罚实施条例、报关员管理办法等规定进行相应处罚。对于担保人涂改、伪造单证等欺骗行为，如果经查实情况严重，则将移交缉私部门处理。
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